0%

拟南芥培养流程

①种子灭菌(均需在超净台作业):

​ 1. 30% NaClO 处理8min(用手震荡或摇床)。

​ 2. ddH2O清洗5遍(至无黄色)。

​ 3. 铺种子至1/2MS培养基。

1
(用1000μl枪头,连同水吸入,挤出至培养基,侧倾培养基,用枪头吸走水分)

​ 4. 封口膜封好后,4℃春化3天。

②放入步入式培养间(25℃)培养7天。

③移入花盆(10 * 10cm)。

1
可铺3 行 * 3 列 或 2 行 * 3 列 ,栽培用土为草碳土:蛭石3 : 1,草炭土和蛭石都需要过筛,细到粉末状。

④浇水不可过频繁,不耐旱涝。

摇菌流程(保菌,提质粒用)

①取原菌液100μl,大肠管(50ml离心管),抗生素(若为kan或其他,则为10μl,若为Zeo,则为3μl),LB液体(10ml)。

②取上述液体加至大肠管(均需在超净台作业),盖好盖子,标清载体名,摇菌时间,摇菌人。

③放入37℃摇床,摇12小时。

④取出每管中500μl至1.5ml离心管(均需在超净台作业),再加入50%甘油500μl。在离心管上标清载体名,保菌时间,保菌人。放入液氮速冻,捞出放入-81℃冰箱。

⑤将剩余菌液照提质粒试剂盒步骤操作,提出质粒后,标清质粒浓度,载体名称,提质粒时间,提质粒人。

HMMER命令行

建立模型

hmmbuild hmm文件 需要转换的文件
hmmbuild PF—.hmm PF—_seed.txt

比对

hmmsearch PF0—.hmm protein.fa > PF—.out

生成 PF—.out 文件

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草木樨培养流程

①种子灭菌(均需在超净台作业):

  1. H2SO4处理3min30s。(用手上下震荡或摇床)
  2. ddH2O清洗3遍。
  3. 75%酒精清洗3min30s。
  4. 5% NaClO 处理5-10min(用手上下震荡或摇床)。
  5. ddH2O清洗5遍。
  6. 铺种子至1/2MS培养基。
  7. 封口膜封好后,4℃春化3天。(选做)

②放入步入式培养间(25℃)培养7天。

③移入花盆(10 * 10cm)。

1
可铺3 行 * 3 列 或 2 行 * 3 列 ,栽培用土为草碳土:蛭石3 : 1,草炭土和蛭石都需要过筛,不需要细到粉末状。

④浇水不可过频繁,不耐旱涝。

引物设计

  • 酵母,根毛转化等载体引物设计—–用snapgene,需要cds序列

  • Q-pcr引物设计—-用perlprimer,需要mrna(cds)、gene序列

cds = mrna

科学研究方法

scientific method

1.Observation
2.Question
3.Research
4.Hypothesis
5.Experiment
6.Data
7.Conclusion