qrt-pcr实验流程
1 设计引物
- 使用perlprimer 5软件
- 导入需要实验的基因的cds(即mrna)列,gene序列
- 设置退火温度范围,碱基数范围
- 交公司合成
- 或另一种办法,使用NCBI pcr引物设计工具 ,参数调为150-200 设计即可
2 冲兑引物(加ddH2O)
- 有些引物为干粉状,需要按照引物管壁上的要求冲兑
3 按照qrt-PCR体系加样
注意除了第一次加物质的枪头外,其余次加物质皆要换枪头。
故极力推荐配置好预混液,这样可减少枪头消耗量。
一 | 二 | 三 | 四 | 五 | 六 | 七 | 八 | 九 | 十 | 十一 | 十二 | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CK | CK | CK | 3H | 3H | 3H | 24H | 24H | 24H | CK | 3H | 24H | |
一 | MaRab1 | MaRab1 | MaRab1 | MaRab1 | MaRab1 | MaRab1 | MaRab1 | MaRab1 | MaRab1 | MaRab23 | MaRab23 | MaRab23 |
二 | MaRab5 | MaRab5 | MaRab5 | MaRab5 | MaRab5 | MaRab5 | MaRab5 | MaRab5 | MaRab5 | MaRab23 | MaRab23 | MaRab23 |
三 | MaRab11 | MaRab11 | MaRab11 | MaRab11 | MaRab11 | MaRab11 | MaRab11 | MaRab11 | MaRab11 | MaRab23 | MaRab23 | MaRab23 |
四 | MaRab13 | MaRab13 | MaRab13 | MaRab13 | MaRab13 | MaRab13 | MaRab13 | MaRab13 | MaRab13 | MaRab25 | MaRab25 | MaRab25 |
五 | MaRab15 | MaRab15 | MaRab15 | MaRab15 | MaRab15 | MaRab15 | MaRab15 | MaRab15 | MaRab15 | MaRab25 | MaRab25 | MaRab25 |
六 | MaRab17 | MaRab17 | MaRab17 | MaRab17 | MaRab17 | MaRab17 | MaRab17 | MaRab17 | MaRab17 | MaRab25 | MaRab25 | MaRab25 |
七 | MaRab19 | MaRab19 | MaRab19 | MaRab19 | MaRab19 | MaRab19 | MaRab19 | MaRab19 | MaRab19 | |||
八 | Acting | Acting | Acting | Acting | Acting | Acting | Acting | Acting | Acting |
1 | MIX | 5μL | ①②③④合计9μL乘12倍(可加8联管之9个小管)为108微升 (此为预混液) 使用引物类似的离心管 |
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2 | 引物1 | 0.2μL | |
3 | 引物2 | 0.2μL | |
4 | ddH2O | 3.6μL | |
5 | cDNA | 1μL | 每个管子加入的cDNA(即处理时间点的不同)不同(不加入到预混液内) |
故①②③④在一起的预混液可加到9个空管子,再朝9个管子内加入不同时间点的cDNA。
4 放入qRT-PCR机器内进行扩增检测
- 设置好扩增程序。
- 设置好加样,基因,处理,重复之实验设计安排,96孔板之排列。
- 开动机器,开始扩增检测。
5 EXCEL处理qrt-PCR之数据
照另外教程即可【Qrt-pcr数据处理流程.md】